Protein–RNA interactions for Protein: Q9D541

Ccdc7, Coiled-coil domain-containing protein 7, mousemouse

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Length 371 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc7Q9D541 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Rbak-202ENSMUST00000165318 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Ccdc7Q9D541 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Ccdc7Q9D541 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Ighv1-60-201ENSMUST00000195816 405 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Ccdc7Q9D541 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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