Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Kcnh7-203ENSMUST00000112454 3073 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 E430018J23Rik-203ENSMUST00000165495 3324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Zcchc8-204ENSMUST00000196282 4350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tyk2-201ENSMUST00000001036 4619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Inpp4a-206ENSMUST00000132615 3038 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Ccdc83Q9D4V3 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms