Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Lpar1-205ENSMUST00000107575 3421 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Acvr1c-201ENSMUST00000028178 9162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Snx20Q9D2Y5 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.5 ms