Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Vmn1r193-202ENSMUST00000227457 6429 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Itga4-201ENSMUST00000099972 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Pigm-201ENSMUST00000052455 7554 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Kcnab2-201ENSMUST00000030768 3533 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmed11Q9D2R4 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmed11Q9D2R4 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmed11Q9D2R4 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmed11Q9D2R4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmed11Q9D2R4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
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Tmed11Q9D2R4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ptchd3-201ENSMUST00000036690 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Tmed11Q9D2R4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
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