Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Gtf2e1Q9D0D5 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mapk8-204ENSMUST00000111944 1528 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.3 ms