Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Cxxc1Q9CWW7 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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Cxxc1Q9CWW7 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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