Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWH6

Psma8, Proteasome subunit alpha type-7-like, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma8Q9CWH6 Kcnb1-204ENSMUST00000207917 11153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Jup-201ENSMUST00000001592 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Psma8Q9CWH6 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Psma8Q9CWH6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Psma8Q9CWH6 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Psma8Q9CWH6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Psma8Q9CWH6 Gm4316-201ENSMUST00000212411 2617 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Hdac5-204ENSMUST00000107152 3788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Bcas3-202ENSMUST00000092821 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Kcnv2-201ENSMUST00000056708 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Psma8Q9CWH6 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms