Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
NubplQ9CWD8 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Fbxo34-205ENSMUST00000168833 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
NubplQ9CWD8 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms