Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN8

Lhfpl3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhfpl3Q9CTN8 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 AC130671.2-201ENSMUST00000227224 1621 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Samd4-206ENSMUST00000137543 6874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Stat1-211ENSMUST00000189347 2588 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Npr2-201ENSMUST00000030191 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Tti2-204ENSMUST00000210129 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Nfx1-203ENSMUST00000098143 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Lactb2-201ENSMUST00000027071 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Ddx11-205ENSMUST00000224497 4141 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Bahcc1-203ENSMUST00000122148 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lhfpl3Q9CTN8 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms