Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hid1-202ENSMUST00000106542 3276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm5053-201ENSMUST00000208361 1678 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms