Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Txlna-202ENSMUST00000084264 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Ngfr-201ENSMUST00000000122 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nicn1Q9CQM0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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Nicn1Q9CQM0 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Mcm9-204ENSMUST00000219838 4132 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Nicn1Q9CQM0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Kcnj5-201ENSMUST00000034533 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Nicn1Q9CQM0 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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