Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Igdcc4-203ENSMUST00000166273 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Q9CQC3 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Q9CQC3 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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