Protein–RNA interactions for Protein: Q99N92

Mrpl27, 39S ribosomal protein L27, mitochondrial, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl27Q99N92 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Mrpl27Q99N92 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Mxd1-201ENSMUST00000001184 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ciz1-204ENSMUST00000113334 2871 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Zscan29-201ENSMUST00000079024 2465 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.32□□□□□ -0.76
Mrpl27Q99N92 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.32□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms