Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm15046-201ENSMUST00000130153 408 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm1335-201ENSMUST00000121653 386 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Gdpd3Q99LY2 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
Gdpd3Q99LY2 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms