Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm13587-201ENSMUST00000152645 366 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm20426-201ENSMUST00000173657 440 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Pagr1aQ99L02 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms