Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TrabdQ99JY4 Mrpl55-203ENSMUST00000108785 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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TrabdQ99JY4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
TrabdQ99JY4 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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