Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tspan1Q99J59 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tspan1Q99J59 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms