Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Gm32390-201ENSMUST00000212713 1172 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
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Rnf144aQ925F3 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rnf144aQ925F3 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
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