Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pex19-201ENSMUST00000075895 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smg8Q8VE18 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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