Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE09

Ttc39c, Tetratricopeptide repeat protein 39C, mousemouse

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Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc39cQ8VE09 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Ttc39cQ8VE09 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Ttc39cQ8VE09 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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