Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Sft2d2Q8VD57 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Trappc8-202ENSMUST00000097658 2703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cldn12-201ENSMUST00000060947 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nlrp6-203ENSMUST00000183845 4436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Sft2d2Q8VD57 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
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