Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCG9

Rfxap, Regulatory factor X-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfxapQ8VCG9 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Cds2-201ENSMUST00000089461 8073 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Plcd4-205ENSMUST00000113749 4648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Palld-202ENSMUST00000121200 4193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Limk2-201ENSMUST00000101638 3514 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Aldh1a7-201ENSMUST00000025656 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
RfxapQ8VCG9 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Trappc11-201ENSMUST00000039061 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gsdma-201ENSMUST00000017348 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 Gm45331-201ENSMUST00000209868 554 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
RfxapQ8VCG9 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms