Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm43267-201ENSMUST00000199664 1796 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hecw1Q8K4P8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm1848-201ENSMUST00000120711 789 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 AC173482.6-201ENSMUST00000225889 1741 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Mrps17-206ENSMUST00000121339 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hecw1Q8K4P8 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms