Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
OptnQ8K3K8 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms