Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Zfp157-203ENSMUST00000110912 886 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Retn-201ENSMUST00000012849 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Upp2Q8CGR7 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms