Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nup88Q8CEC0 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nup88Q8CEC0 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nup88Q8CEC0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nup88Q8CEC0 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nup88Q8CEC0 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nup88Q8CEC0 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Adra1a-206ENSMUST00000225182 2337 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Nup88Q8CEC0 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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