Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Atp6v1b1-201ENSMUST00000006431 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Mymx-203ENSMUST00000178858 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm43377-201ENSMUST00000201640 455 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm11685-201ENSMUST00000141559 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Zbtb16-201ENSMUST00000093852 5114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 1500009C09Rik-202ENSMUST00000143238 1552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Ssuh2Q8C3L1 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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