Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKV1

Gpc2, Glypican-2, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc2Q8BKV1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Tsc22d1-206ENSMUST00000134109 801 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm20535-201ENSMUST00000173157 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gpc2Q8BKV1 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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