Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nop53Q8BK35 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Nop53Q8BK35 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nop53Q8BK35 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Nop53Q8BK35 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
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Nop53Q8BK35 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
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Nop53Q8BK35 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Zfp385c-201ENSMUST00000103119 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Nop53Q8BK35 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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