Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

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Length 910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Smarcal1Q8BJL0 Gm14263-201ENSMUST00000117955 746 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Ip6k2-204ENSMUST00000192307 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Smarcal1Q8BJL0 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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