Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH32

Susd4, Sushi domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd4Q8BH32 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Susd4Q8BH32 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Susd4Q8BH32 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms