Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Naaladl1-201ENSMUST00000044451 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
H2-M10.4Q85ZW8 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms