Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
Smim19Q80ZU4 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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Smim19Q80ZU4 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Smim19Q80ZU4 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
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