Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Zbtb40Q6PCS8 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Zbtb40Q6PCS8 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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