Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Zfp369-203ENSMUST00000130799 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Mocs2-203ENSMUST00000164737 745 ntTSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm5455-201ENSMUST00000058710 715 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm13996-201ENSMUST00000118456 430 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm8285-201ENSMUST00000208293 759 ntBASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Hexim2-202ENSMUST00000107037 1221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
PtprdQ64487 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms