Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm6430-201ENSMUST00000054664 1248 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Lyar-202ENSMUST00000114106 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Ccdc18Q640L5 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ccdc18Q640L5 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Ccdc18Q640L5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
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Ccdc18Q640L5 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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