Protein–RNA interactions for Protein: Q62205

Scn9a, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn9aQ62205 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Scn9aQ62205 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Scn9aQ62205 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Olfr431-ps1-201ENSMUST00000192435 544 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Scn9aQ62205 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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