Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm27341-201ENSMUST00000183570 106 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm13366-201ENSMUST00000122198 970 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Itga6Q61739 Gm37641-201ENSMUST00000193837 239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms