Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 4930448A20Rik-201ENSMUST00000205988 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Calca-201ENSMUST00000032906 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Cnpy2-202ENSMUST00000219037 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 1700003G13Rik-202ENSMUST00000131342 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm38804-201ENSMUST00000203998 767 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Lman1l-202ENSMUST00000093832 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Cln3Q61124 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms