Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Nccrp1-201ENSMUST00000057974 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Slc6a4Q60857 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc6a4Q60857 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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