Protein–RNA interactions for Protein: Q60809

Cnot7, CCR4-NOT transcription complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot7Q60809 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Nceh1-202ENSMUST00000091284 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 S100a16-206ENSMUST00000107335 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 D8Ertd738e-201ENSMUST00000019506 616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 CT025551.1-201ENSMUST00000223996 692 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Cnot7Q60809 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Gm7851-201ENSMUST00000117574 323 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Tmem74bos-201ENSMUST00000137422 390 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Cnot7Q60809 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms