Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim38Q5SZ99 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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Trim38Q5SZ99 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Trim38Q5SZ99 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
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