Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

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Length 2,382 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Lsp1-205ENSMUST00000105968 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mrpl23-206ENSMUST00000210662 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pgbd5-203ENSMUST00000136892 1739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Fam208bQ5DTT3 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
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