Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 9330182L06Rik-204ENSMUST00000134991 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Snx33Q4VAA7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms