Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 1700047I17Rik2-201ENSMUST00000177978 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Avpr2-202ENSMUST00000101470 2787 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Adgre5-208ENSMUST00000166939 2980 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Tcf4-243ENSMUST00000202057 1941 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Fam220aQ3ZN08 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms