Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1H9

Samd5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd5Q3V1H9 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Samd5Q3V1H9 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Samd5Q3V1H9 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms