Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm5863-201ENSMUST00000121760 1008 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm38317-201ENSMUST00000195564 343 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ulk4Q3V129 Gm14809-201ENSMUST00000152025 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms