Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Pga5-201ENSMUST00000025647 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Dhrs2-201ENSMUST00000022820 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Chpf2Q3UU43 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms