Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm9550-201ENSMUST00000161130 862 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dhrs4-202ENSMUST00000226168 828 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Rbpsuh-rs3-201ENSMUST00000182751 1441 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Vps25-204ENSMUST00000107280 876 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dixdc1-204ENSMUST00000118707 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm9555-201ENSMUST00000200908 583 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ctsll3Q3ULP7 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms