Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

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Length 262 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Nkx6-3Q3UHX8 Kif5c-201ENSMUST00000028102 6856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Nkx6-3Q3UHX8 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Nkx6-3Q3UHX8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
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